Kolon kanserinin teşhisinde kolonoskopi, sigmoidoskopi, CT taraması, manyetik rezonans görüntüleme (MR), dışkı testi ve biyopsi gibi yöntemler kullanılır. Kolonoskopi, uzun bir tüp ile kalın bağırsağın incelenmesini sağlar ve polip veya anormal dokuların çıkarılması için kullanılır. Sigmoidoskopi, kolonoskopinin benzeridir ancak sadece rektum ve sigmoid kolonun incelenmesini sağlar. CT ve MR taramaları, kolonun detaylı görüntülerini sunar. Biyopsi, şüpheli dokudan örnek alınarak mikroskop altında incelenmesini sağlar.